Systém živých organizmov

Živé organizmy (po latinsky Biota alebo Vitae) sa taxonomicky členia rôzne. Nasleduje prehľad najbežnejších delení, ako aj delenie používané v tejto Wikipédii.

Orientačný prehľad vzťahov pojmov podľa moderných delení

Delenie používané v tejto Wikipédii

Vírusy

Nešpecifikovaná skupina vírusy (na úrovni domény)

Baktérie

Doména Bacteria* (Eubacteria; nepresne Prokarya, Prokaryota) – baktérie (eubaktérie):

Baktérie

(Jediná) Ríša Bacteria (Eubacteria) – baktérie (eubaktérie) [podľa (1) a (2)]:

Kmeň/Oddelenie Trieda Rad
Aquificae Aquificae Aquificales
Thermotogae Thermotogae Thermotogales
Thermodesulfobacteria Thermodesulfobacteria Thermodesulfobacteriales
Deinococcus-Thermus Deinococci Deinococcales
Thermales
Chrysiogenetes Chrysiogenetes Chrysiogenales
Chloroflexi Chloroflexi Chloroflexales
Herpetosiphonales
Anaerolineae Anaerolineales
Thermomicrobia Thermomicrobia Thermomicrobiales
Nitrospira Nitrospira Nitrospirales
Deferribacteres Deferribacteres Deferribacterales
Cyanobacteria Cyanobacteria Subsekcie I – V
Chlorobi Chlorobia Chlorobiales
Proteobacteria Alphaproteobacteria Rhodospirillales
Rickettsiales
Rhodobacterales
Sphingomonadales
Caulobacterales
Rhizobiales
Parvularculales
Betaproteobacteria Burkholderiales
Hydrogenophilales
Methylophilales
Neisseriales
Nitrosomonadales
Rhodocyclales
Procabacteriales
Gammaproteobacteria Chromatiales
Acidithiobacillales
Xanthomonadales
Cardiobacteriales
Thiotrichales
Legionellales
Methylococcales
Oceanospirillales
Pseudomonadales
Alteromonadales
Vibrionales
Aeromonadales
Enterobacteriales
Pasteurellales
Deltaproteobacteria Desulfurellales
Desulfovibrionales
Desulfobacterales
Desulfarcales
Desulfuromonales
Syntrophobacterales
Bdellovibrionales
Myxococcales (3 podrady)
Epsilonproteobacteria Campylobacterales
Firmicutes Clostridia Clostridiales
Thermoanaerobacteriales
Haloanaerobiales
Mollicutes Mycoplasmatales
Entomoplasmatales
Acholeplasmatales
Anaeroplasmatales
Incertae sedis
Bacilli Bacillales
Lactobacillales
Actinobacteria Actinobacteria Acidimicrobiales
Rubrobacterales
Coriobacteriales
Sphaerobacterales
Actinomycetales (17 podradov)
Bifidobacterales
Planctomycetes Planctomycetacia Planctomycetales
Chlamydiae Chlamydiae Chlamydiales
Spirochaetes Spirochaetes Spirochaetales
Fibrobacteres Fibrobacteres Fibrobacterales
Acidobacteria Acidobacteria Acidobacteriales
Bacteroidetes Bacteroidetes Bacteroidales
Flavobacteria Flavobacteriales
Sphingobacteria Sphingobacteriales
Fusobacteria Fusobacteria Fusobacteriales
Verrucomicrobia Verrucomicrobiae Verrucomicrobiales
Dictyoglomi Dictyoglomi Dictyoglomales
Gemmatimonadetes Gemmatimonadetes Gemmatimonadales

plus:

  • Čeľaď Halanaerobiaceae
  • Rod Acetanaerobacterium Chen & Dong, 2004
  • Rod Acidilobus Prokofeva et al., 2000
  • Rod Actinopolymorpha Wang et al., 2001
  • Rod Advenella Coenye et al., 2005
  • Rod Aequorivita Bowman & Nichols, 2002
  • Rod Aeriscardovia Simpson et al., 2004
  • Rod Aestuariibacter Yi et al., 2004
  • Rod Agarivorans Kurahashi & Yokota, 2004
  • Rod Agreia Evtushenko et al., 2001
  • Rod Akkermansia Derrien et al., 2004
  • Rod Albibacter Doronina et al., 2001
  • Rod Albidovulum Albuquerque et al., 2003
  • Rod Algibacter Nedashkovskaya et al., 2004
  • Rod Algoriphagus Bowman et al., 2003
  • Rod Alicycliphilus Mechichi et al., 2003
  • Rod Alistipes Rautio et al., 2003
  • Rod Alkalibacterium Ntougias & Russell, 2001
  • Rod Alkalilimnicola corrig. Yakimov et al., 2001
  • Rod Alkaliphilus Takai et al., 2001
  • Rod Alkalispirillum Rijkenberg et al., 2002
  • Rod Alkanindiges Bogan et al., 2003
  • Rod Allisonella Garner et al., 2003
  • Rod Allofustis Collins et al., 2003
  • Rod Amorphosporangium Couch, 1963
  • Rod Amycolata Lechevalier et al., 1986
  • Rod Anaerococcus Ezaki et al., 2001
  • Rod Anaerofustis Finegold et al., 2004
  • Rod Anaeroglobus Carlier et al., 2002
  • Rod Anaerolinea Sekiguchi et al., 2003
  • Rod Anaeromyxobacter Sanford et al., 2002
  • Rod Anaerophaga Denger et al., 2002
  • Rod Anaerostipes Schwiertz et al., 2002
  • Rod Anaerotruncus Lawson et al., 2004
  • Rod Anoxynatronum Garnova, Zhilina & Tourova, 2003
  • Rod Aquicella Santos et al., 2004
  • Rod Aquiflexum Brettar et al., 2004
  • Rod Aquimarina Nedashkovskaya et al., 2005
  • Rod Arcicella Nikitin et al., 2004
  • Rod Arenibacter Ivanova et al., 2001
  • Rod Asanoa Lee & Hah, 2002
  • Rod Atopostipes Cotta et al., 2004
  • Rod Aurantimonas Denner et al., 2003
  • Rod Avibacterium Blackall et al., 2005
  • Rod Azomonotrichon Thompson & Skerman, 1981
  • Rod Azorhizophilus Thompson & Skerman, 1981
  • Rod Bactoderma Tepper & Korshunova, 1973
  • Rod Balnearium Takai et al., 2003
  • Rod Balneimonas corrig. Takeda et al., 2004
  • Rod Halanaerobacter
  • Rod Halanaerobium
  • Rod Pelagibacter
  • Rod Tetrachloris Pascher, 1925

Archaea

Doména Archaea* (zast. Archaebacteria) – zast. archebaktérie [podľa (1), (2) a angl. wiki]:

  • Kmeň Crenarchaeo
  • Kmeň Euryarchaeota (Woese, Kandler & Wheelis, 1990)
  • Kmeň Nanoarchaeota Huber et al., 2002 – považované aj za súčasť Euryarchaeota
  • Kmeň Korarchaeota – zaradenie sporné

Eukaryoty

Doména Eukaryota (Eukarya) – eukaryoty (jadrové organizmy):

Prvoky

Ríša: Protozoaprvoky – v starom systéme niektoré nižšie rastliny (Thallobionta) a huby (Fungi) a všetky živočísne jednobunkovce (Monocytozoa, prvoky) [podľa (3),(4), (6) a čiastočne (2); uvedená systematika nie je úplná pre nižšie úrovne a asi nie celkom úplná pre najvyššiu úroveň]:

  • Oddelenie/kmeň Acrasiomycotabunkové slizovky/ akrázie – v starom slov. systéme súčasť oddelenia slizovky
  • Oddelenie/kmeň Myxomycota v užšom zmysle – (pravé) slizovky
  • Oddelenie/kmeň Plasmodiophoromycotanádorovky- v starom slov. systéme súčasť oddelenia slizovky
  • Oddelenie/kmeň Chlorarachniophyta
  • Oddelenie/kmeň Euglenophytaeuglény/ červenoočká
  • Oddelenie/kmeň Dinophytapanciernatky
  • Kmeň/Oddelenie Sarcomastigophorakoreňonožcobičíkovce – najnovšie bez opalín (tie sú v heterokontophyta)
  • Kmeň/Oddelenie Labyrinthomorphalabyrintky
  • Kmeň/Oddelenie Apicomplexa (Sporozoa)- výtrusovce
  • Kmeň/Oddelenie Ascetosporaascetospóry
  • ? Kmeň /Oddelenie Hemimastigophorabičíkobrvce – známe aj ako Hemimastitigida
  • Kmeň/Oddelenie Pseudociliatea (Primociliatea)- panálevníky
  • Kmeň/Oddelenie Ciliophora
Poznámka 1: z tzv. nižších rastlín (Thalliobonta) v starom systéme (3) sinice (Cyanophyta) a prvozelené riasy (Prochlorophyta) patria do baktérií, a červené riasy (Rhodophyta) a zelené riasy (Chlorophyta) zostávajú v rastlinách.
Poznámka 2: V tomto systéme sa medzi "nižšie rastliny" zaraďujú: ríša prvoky (čiastočne), ďalej ríša Chromista, ríša huby, podríša Biliphytae, a z podríše zelené rastliny vývojová línia Chlorophytae a vývojová línia Streptophytae. Oproti starému systému sem teda patria aj machorasty.

Chromista

Ríša: Chromista – v starom systéme niektoré nižšie rastliny (Thallobionta) a huby (Fungi) [podľa (4); uvedená systematika nie je celkom úplná pre najvyššiu úroveň]

  • podríša Cryptistae
  • podríša Chromobiotae
    • oddelenie Labyrinthulomycota (?Hydromyxomycetes)- vodné slizovky
    • oddelenie Peronosporomycota (Oomycota) – riasovky
      • trieda Peronosporomycetes (Oomycetes)
    • oddelenie Hyphochytriomycotabunkovčeky
      • trieda Hyphochytridiomycetes
    • oddelenie Heterokontophyta (Chromophyta, Heterokonta) – rôznobičíkaté riasy
      • trieda Chrysophyceaežltohnedé riasy
      • trieda Tribophyceae (Xanthophyceae) – žltozelené riasy
      • trieda Eustigmatophyceae – v starom systéme samostatné oddelenie
      • trieda Bacillariophyceaerozsievky
      • trieda Fucophyceae (Phaeophyceae) – hnedé riasy, chaluhy
      • trieda Raphidophyceaezelenivky
    • oddelenie Haptophyta
      • trieda Prymnesiophyceae

Huby

Tu je uvedená, len tá (podstatná) časť systému, ktorá sa vyskytuje vo väčšine súčasných systémov (rok 2007), podrobnosti pozri v článku huby. V starých systémoch do húb patrili aj niektoré Chromista a prvoky.

  • oddelenie Chytridiomycotabunkovky/chytrídie/chytrídiomycéty
  • oddelenie Microsporidiamikrosporídie – podľa štúdie z roku 2006 ich možno zaradiť aj ako sesterský taxón húb; staršie sa zaraďovali úpne mimo húb, medzi prvoky a podobne
  • oddelenie Glomeromycota
  • oddelenie Zygomycotaplesne – existencia tohto taxónu je najnovšie (2007) sporná
  • oddelenie Ascomycotavreckaté huby/ askomycéty
  • oddelenie Basidiomycotabazídiové huby/bazídiomycéty
  • …(incertae sedis a iné oddelenie/oddelenia meniace sa podľa autora/zdroja)

Rastliny

Ríša Plantaerastliny – v starom systéme vrátane Chromista a niektorých prvokov

Živočíchy

Ríša Animaliaživočíchy – v starom systéme Podríša mnohobunkovce (Polycytozoa) [podľa (3) a (6)]

Poznámky

(*) Archaea+ Bacteria (prípadne + vírusy)= prokaryoty (prvojadrové organizmy)
Zdroje
(1) Garrity, G. M.; J. A. Bell und T. G. Lilburn: "Taxonomic Outline of the Prokaryotes. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology", Second Edition, Release 5.0, Springer-Verlag, New York, 2004
(2) Taxonomicon (Systema naturae 2000; verzia z apríla-mája 2006, niektoré časti tejto verzie už nie sú dostupné online)
(3) Bioweb-Systém živej prírody (dnes: Biopedia-Systém živej prírody)
(4) nižšie rastliny
(5) vyššie rastliny
(6) bezchordáty (Franc 2005)

Iné systémy

Prehľad vybraných systémov

Linnaeus
1735
2 ríše
Haeckel
1866
3 ríše
Chatton
1937
2 impériá
Copeland
1956
4 ríše
Whittaker
1969
5 ríš
Woese et al.
1977
6 ríš
Woese et al.
1990
3 ríše
(neanalyzované) Protista Prokaryota Monera Monera Eubaktérie Baktérie
Archebaktérie Archaea
Eukaryota Protoctista Protista Protista Eukarya
Rastliny Rastliny Huby Huby
Rastliny Rastliny Rastliny
Živočíchy Živočíchy Živočíchy Živočíchy Živočíchy

(Ekvivalencie v tejto tabuľke nie sú zobrazené do všetkých detailov, napriek tomu je to užitočný zjednodušený prehľad)

Linné 18. stor.

Copeland 1956

Eukaryoty sú len súhrnný názov pre posledné tri ríše.

Whittacker 1969

Eukaryoty len súhrnný názov pre spodné 4 ríše. Často sa označujú ako „nadríša“.

Toto bolo desaťročia veľmi populárne delenie a v podstate sa s obmenami používa dodnes.

Starý systém ešte vyučovaný na slovenských gymnáziách (okolo 2000)

  • (Nadríša:) Prokaryoty/Prvojadrové organizmy (Prokaryota)
    • ríša: nebunkové organizmy (Subcellulata)
      • oddelenie: praorganizmy (Eobionta, Progenota) – vyhynuté, hypotetické organizmy, z ktorých sa vyvinuli všetky ostatné organizmy; v iných deleniach väčšinou nezohľadňované
      • oddelenie: vírusy (Vira)
    • ríša: prvobunkové organizmy (Protocellulata)
      • oddelenie: baktérie (Bacteria)
      • oddelenie: sinice (Cyanophyta)
      • oddelenie: prochlorofyty (Prochlorophyta) – v moderných deleniach medzi baktériami
  • (Nadríša:) Eukaryoty/Jadrové organizmy (Eukaryota):

Takéto delenie je dnes vo viacarých smeroch prekonané.

Iné tradičné delenie na Slovensku

Eukaryoty sú len súhrnné označenie („nadríša“ a pod.) pre posledné tri podríše a časť prvej podríše.

Takéto delenie sa dnes ešte používa aspoň na určenie toho, čo spadá do „kompetencie“ botanikov a čo do kompetencie zoológov.

Woese 1977 (Text)

Eukaryoty sú len súhrnný názov pre spodné 4 ríše. Často sa označujú ako „nadríša“.

Vírusy nie sú zohľadnené.

Woese 1990 (Text) a iní

Vírusy nie sú zohľadnené.

Cavalier-Smith (1998, 2004) a iní

Vírusy nie sú zohľadnené.

Podľa BioLibu

Poznámka: Takéto vyčleňovanie pomerne „novej“ skupiny Archaezoa spod prvokov je ale cca v roku 2004 už zase prekonané a v nových deleniach už ani len jej členovia netvoria jednotnú skupinu.

Podľa Tohto zdroja – ide prevažne o aktualizovanú prácu: J. Patterson (1999)

Poznámka: Čo zahŕňajú jednotlivé nižšie uvedené skupiny možno najlepšie odhadnúť podľa moderného delenia uvedeného v článku Prvoky.

  • vírusy – sporné
  • eubaktérie
  • Archaea – monofyletickosť skupiny sporná
  • eukaryoty (podľa abecedy):
    • Alveolata – patrí sem Dinoflagellata, Apicomplexa, Ciliata
    • Acantharea
    • Ancyromonas (rod)
    • Apusomonada (skupina rodov)
    • Biomyxa (rod)
    • Centroheliozoa (skupina rodov)
    • Cercomonads (skupina rodov)
    • Chlorarachniophyta
    • Coelosporidium
    • Collodictyon (rod)
    • Copromyxida
    • Cryothecomonas (rod)
    • Cryptomonada (skupina rodov)
    • Desmothoracida (skupina rodov)
    • Dimorphida (skupina rodov)
    • Diphylleia (rod)
    • Discocelis (rod)
    • Ebriida (skupina rodov)
    • Ellobiopsida (skupina rodov)
    • Entamoebidae (skupina rodov)
    • Excavata (bičíkovce, diplomonády, Jakobida, Retortamonada, Trimastix, Carpedediemonas, Heterolobosea, etc.)
    • Euglenozoa (bičíkovce, euglény a kinetoplastidy)
    • Fonticula (rod)
    • Glaucophyta
    • Granuloreticulosa
    • Gymnophrea (skupina rodov)
    • Gymnosphaerida
    • Haplosporida
    • Haptophyta
    • Kathablepharida (skupina rodov)
    • Komokiacea
    • Luffisphaera
    • Ministeria (rod)
    • Multicilia (rod)
    • Nephridiophagida
    • Nucleariidae
    • Opistokontha:
    • Oxymonada (skupina rodov)
    • Parabasalida (skupina rodov)
    • Paramyxea
    • Pelobionta (skupina rodov)
    • Phaeodarea
    • Phagodinium
    • Phalansterium (rod)
    • Plasmodiophorida
    • Polycystinea
    • Pseudospora
    • Ramicristates
    • Rhodophyta (červené riasy)
    • Rosette agent
    • Spironemidae (skupina rodov)
    • Spongomonada (skupina rodov)
    • Stephanopogon (rod)
    • Sticholonche (rod)
    • Stramenopila
    • Telonema (rod)
    • Thaumatomonada (skupina rodov)
    • Vampyrellida
    • Viridaeplantae (zelené rastliny)
    • Xenophyophorea
    • iné, nezaradené

Adl et. al. 2005

Kolektív autorov (Adl et al. 2005 – Journal of Eukaryotic Microbiology 52: 399 – 451) dospel k nasledujúcemu úplne novému deleniu (zaoberali sa len eukaryotmi), ktoré sa asi stane štandardom v nasledujúcich rokoch.

Toto delenie je výsledkom kombinácie fylogenetického prístupu založeného na bázových sekvenciách DNA na jednej strane a morfologických znakov na strane druhej.

Ako vidno, podľa tohto delenia nie je vedecky správne rastliny, živočíchy a huby v systematike oddeliť od Protistov (jednobunkových organizmov), lebo sa z nich vyvinuli a nie je teda dôvod deliť organizmy na také hlavné skupiny ako sa to robilo doteraz. V konečnom dôsledku tak toto delenie paradoxne ukazuje hlavne to, čo sa tradične označovalo ako Protista.

Poznámka: Čo zahŕňajú jednotlivé nižšie uvedené skupiny možno najlepšie odhadnúť podľa moderného delenia uvedeného v článku Prvoky.

Delenie:

Pozri aj

Biologický portál
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.