Seznam kostelů a modliteben v Českých Budějovicích

Většina náleží katolíkům (České Budějovice zůstaly nepokořenou baštou katolicismu i za husitských válek), z pozdějších dob pocházejí kostely a modlitebny československé církve husitské a dalších protestantských církví a denominací. Dva nejstarší kostely (katedrála svatého Mikuláše a klášterní kostel Obětování Panny Marie) náleží k nejvýznamnějším historickým a kulturním památkám České republiky.

Seznam obsahuje síňové a domácí kaple, tedy takové, které uzavírají prostor chápaný jako modlitebnu. Kaple výklenkové a jim podobná zděná boží muka obsahuje samostatný seznam drobných sakrálních památek v Českých Budějovicích.

Název	Obrázek	Církev	Umístění	Založení	Galerie	Popis
Betlémský sbor		čsl. husitská	Lidická 218			Rožnov, Lidická 1120/218, bohoslužby pravidelně v neděli od 8 hodin.
Husův dům		čsl. husitská	U Výstaviště 10		Kategorie „Husův dům (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Čtyři Dvory, U Výstaviště 509/10, poblíž autobusové zastávky U Parku, bohoslužby pravidelně v neděli od 11 hodin.
Husův sbor		čsl. husitská	Palackého náměstí 1	1924	Kategorie „Husův sbor (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Palackého náměstí, bohoslužby pravidelně v neděli od 9 hodin.
kaple Nanebevzetí Panny Marie		římskokatolická	náměstí Švabinského	1883	Kategorie „Chapel of the Assumption of Virgin Mary (Mladé)“ na Wikimedia Commons	Mladé, novogotická návesní kaple. Modlitby v úterý v 17 hodin.
kaple Nejsvětějšího Srdce Ježíšova		římskokatolická	Jirsíkova 5	1991		Školní kaple Biskupského gymnázia, zřízení povolil brněnský biskup 1. 9. 1991.
kaple Panny Marie		římskokatolická	Biskupská 4	18. století		Domácí kaple v biskupské rezidenci zasvěcená Panně Marii, kde je uložen originál obrazu Panny Marie Budějovické.
kaple Smrtelných úzkostí Páně		římskokatolická*	Kněžská	1727–1731	Kategorie „kaple Smrtelných úzkostí Páně (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	*Ve čtvrtek a v přikázané svátky v 19:00 řeckokatolické bohoslužby.[1] Křižovatka ulic Kanovnická a Kněžská.
kaple svaté Karoliny		římskokatolická	hřbitov Mladé	1891		Mladé, novogotická hřbitovní kaple. Původně hrobka rodu Kleinů a Marionů.[2]
kaple svaté Otýlie		římskokatolická	hřbitov svaté Otýlie	1891	Kategorie „Chapel of Saint Odile (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Novorománská hřbitovní kaple. Bohoslužby v neděli od 9:30.[1]
kaple svatého Gorazda		římskokatolická	Puchmajerova 2	2004		Suché Vrbné, zřízena v kněžském domově v roce 2004.
kaple svatého Jana Nepomuckého		římskokatolická	Třebotovice	1862–1863		Novorománská kaple se zvoničkou byla vysvěcena 16. května 1863.[2]
kaple svatého Josefa		římskokatolická	Na Sadech 19	1871	Kategorie „Kaple svatého Josefa (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Bývalé Vídeňské předměstí, kaple kláštera kongregace Školských sester de Notre Dame v domě U Svatého Josefa. Bohoslužby denně v 6:30.[1]
kaple Teologické fakulty		římskokatolická	Kněžská 8		Kategorie „Chapel at Faculty of Theology (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Ve druhém patře budovy Teologické fakulty. Veřejnosti běžně nepřístupná.
kaple v Kališti		římskokatolická	Kaliště	1874		Výstavba novorománské kaple se zvoničkou byla povolena 7. května 1872.[2]
kaple Všech svatých země české		pravoslavná	Husova třída	1869	Kategorie „Kaple Všech svatých země české (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Čtyři Dvory, křižovatka ulic Husova a Sukova. Barokní, původně římskokatolickou kapli svatého Vojtěcha v majetku města užívá od roku 1993 pravoslavná církev. Bohoslužby každou druhou neděli v měsíci od 8:30.
katedrála svatého Mikuláše		římskokatolická	U Černé věže	<1297	Kategorie „Cathedral of Saint Nicholas (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	V centru u severovýchodního roku náměstí Přemysla Otakara II. V letech 2011-2013 byla katedrála opravena. Rozpis bohoslužeb zde.
klášterní kostel Obětování Panny Marie		římskokatolická	Piaristické náměstí	1265	Kategorie „Church of Presentation of the Virgin Mary (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Historické jádro, bývalý dominikánský konvent. Rozpis bohoslužeb v samostatném článku.
kostel Božského srdce Páně		římskokatolická	Rudolfovská třída	1903–1904	Kategorie „Church of the Sacred Heart (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Na křižovatce ulic Lipenská a Rudolfovská (č. p. 1980). Součást kláštera kongregace sester Nejsvětější Svátosti. Bohoslužby v 7:00 (úterý, pátek), v 8:00 (neděle) a v 18:00 (pondělí, středa, čtvrtek, sobota).[1]
kostel Českobratrské církve evangelické		evangelická	28. října 26	~1900	Kategorie „Evangelical church (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Kostel vystavěný německými luterány sloužil do roku 1934 německému evangelickému sboru i pro sbor Českobratrské církve evangelické.
kostel Panny Marie Královny Andělů		římskokatolická	Novohradská	1938–1940	Kategorie „Church of Our Lady the Queen of Angels (Nové Hodějovice)“ na Wikimedia Commons	Nové Hodějovice, křižovatka Novohradské a Ke Studánce. Bohoslužby každou neděli od 10:30.[1]
kostel Panny Marie Růžencové		římskokatolická	Žižkova třída 4	1899–1900	Kategorie „Church of the Virgin Mary of the Rosary in České Budějovice“ na Wikimedia Commons	Součást kláštera Kongregace bratří Nejsvětější Svátosti (petrínů). Bohoslužby v 9:00 krom pondělí (v 17:00) a čtvrtka (v 16:00).[1]
kostel svatého Cyrila a Metoděje		římskokatolická	Puchmajerova 2	1935	Kategorie „Church of Saints Cyril and Methodius (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Suché Vrbné, součást původního kláštera kongregace bratří těšitelů z Gethseman (fungoval do roku 1950). Bohoslužby v pátek v 17:00 a v neděli v 8:30.[1]
kostel svatého Jana Nepomuckého		římskokatolická	Boženy Němcové	1914–1915	Kategorie „Church of Saint John of Nepomuk (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Mezi ulicemi Boženy Němcové, Generála Svobody a Jánská. Zajímavostí stavby je teplovzdušné podlahové vytápění. Bohoslužby v 7:30 (středa, pátek), v 9:00 (neděle) a v 18:00 zimního (resp. standardního) času nebo 19:00 letního času (čtvrtek, sobota).[1]
kostel svatého Jana Křtitele a svatého Prokopa		římskokatolická	Staroměstská	13. století	Kategorie „Kostel svatého Jana Křtitele a svatého Prokopa (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Křižovatka ulic Staroměstská a Puklicova, nejstarší kostel na současném území Českých Budějovic, který exist:oval již před založením města. Bohoslužby v pátek (16:30 zimního, resp. standardního času nebo 17:30 letního času) a v neděli (8:30).[1]
kostel svaté Rodiny		římskokatolická	Karla IV.	1886–1888	Kategorie „Church of the Holy Family (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Senovážné náměstí, křižovatka ulic Karla IV. a Jirsíkova.
kostel svatého Václava		římskokatolická	Kostelní	1868–1870	Kategorie „Church of Saint Wenceslaus (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Jižní část kostelní ulice, pod bývalým hotelem Gomel. Od října do června první úterý v měsíci od 18:00 bohoslužba slova, pravidelné boholsužby v neděli od 11:00.[1]
kostel svatého Vojtěcha		římskokatolická	Emy Destinové	1938–1939	Kategorie „Church of Saint Adalbert of Prague (České Budějovice)“ na Wikimedia Commons	Součást farnosti svatého Vojtěcha spravované salesiány. Rozpis bohoslužeb v samostatném článku.
modlitebna Adventistů sedmého dne		adventisté	Fráni Šrámka 34			Budova využívána od roku 1933, po revoluci vybudována nová s kapacitou 200 osob. Průčelí sálu zdobí malba na skle výtvarníka Zenkla z roku 1992.
modlitebna Apoštolské církve		apoštolská	Riegrova 17			První patro činžovního domu v Riegrově ulici.
modlitebna Bratrské jednoty baptistů		baptisté	U Hvízdala 9a			U centra Arpida, postavena někdy mezi lety 2003 a 2006.
modlitebna Církve bratrské		bratrská	J. Š. Baara 64			Dům s pozemkem daroval sboru v roce 1906 bratr Zícha. Nová (prostornější) modlitebna otevřena roku 2000.
nemocnice		římskokatolická	areál nemocnice			Bohoslužby ve čtvrtek od 14 hodin (pokud je zájem).[3][4]; od počátku roku 2018 slouží v nemocnici kaplan[5]
Sbor Ježíše, knížete míru		čsl. husitská	Vítězslava Nezvala 43	1953		Suché Vrbné, bohoslužby pravidelně v neděli v 9:15.

Často se mezi budějovické kostely uvádí i katolický poutní kostel Panny Marie Bolestné v Dobré Vodě. Dobrá Voda byla ve druhé polovině 20. století součástí Českých Budějovic. Dnes je však samostatnou obcí, takže toto zařazení je sporné.