Nukleotid
Nukleotidy jsou fosforylované nukleosidy, tedy látky složené z nukleové báze (nejčastěji purinové nebo pyrimidinové), pětiuhlíkatého monosacharidu (ribóza nebo deoxyribóza) a jednoho nebo více zbytků kyseliny fosforečné. Jsou stavebními kameny nukleových kyselin a kofaktorů, které v buňce přenášejí energii, účastní se procesů biologických syntéz (mj. kondenzačních reakcí) a buněčné komunikace.
Názvosloví
Názvosloví nukleotidů odpovídá stavbě daného nukleotidu: například adenosinmonofosfát je nukleotid skládající se z adenosinu, nukleosidu tvořeného bází adeninem a ribosou, a jednoho fosfátu.
Umístění fosfátové skupiny v nukleotidech se značí číslicí s čárkou ('). Například adenosin-3'-monofosfát znamená, že fosfátová skupina je navázána na třetím uhlíkovém atomu ribosy. Nejčastěji je fosforylován uhlík číslo 5, proto se v tomto případě označení vynechává. Adenosin-5'-monofosfát = adenosinmonofosfát.
Podle toho, zda obsahují nukleotidy ribózu nebo deoxyribózu, se rozlišují:
Zkratky názvů
Pro zjednodušení názvosloví byly zavedeny čtyř- nebo třípísmenné zkratky. První písmeno je malé a značí, jestli je součástí nukleotidu ribóza (nepíše se nic) nebo deoxyribóza (malé d). Je-li struktura nukleotidu cyklická, označuje se malým c (cyklický adenosin-3‘,5‘-monofosfát = cAMP) Druhé, velké písmeno označuje druh nukleové báze:
Třetí a čtvrté písmeno určují počet fosfátových skupin (mono-, di-, tri-) a přítomnost fosfátu (P). Například deoxycytidintrifosfát má zkratku dCTP.
Anhydridová vazba
Fosfátové skupiny v nukleosiddifosfátech a nukleosidtrifosfátech jsou navázané jedna za druhou anhydridovou vazbou. Ty jsou schopny přenášet funkční skupiny a při hydrolýze těchto vazeb se uvolní velké množství energie (Δ G < −30 kJ/mol). Proto jsou nukleotidy sloučeninami, které umožňují aktivaci reaktantů a průběh endergonických reakcí.
Základní nukleotidy
Ribonukleotidy
 adenosinmonofosfát AMP |
 adenosindifosfát ADP |
 adenosintrifosfát ATP |
 guanosinmonofosfát GMP |
 guanosindifosfát GDP |
 guanosintrifosfát GTP |
 uridinmonofosfát UMP |
 uridindifosfát UDP |
 uridintrifosfát UTP |
 cytidinmonofostát CMP |
 cytidindifosfát CDP |
 cytidintrifosfát CTP |
Deoxyribonukleotidy
 deoxyadenosinmonofosfát dAMP |
 deoxyadenosindifosfát dADP |
 deoxyadenosintrifosfát dATP |
 deoxyguanosinmonofosfát dGMP |
 deoxyguanosindifosfát dGDP |
 deoxyguanosintrifosfát dGTP |
 deoxythymidinmonofosfát dTMP |
 deoxythymidindifosfát dTDP |
 deoxythymidintrifosfát dTTP |
 deoxycytidinmonofosfát dCMP |
 deoxycytidindifosfát dCDP |
 deoxycytidintrifosfát dCTP |
Koenzymy, jejichž součástí je nukleotid
- aktivní sulfát (adenosin-3'-fosfát-5'-fosfosulfát)
- aktivní methionin (S-adenosylmethionin)
- aminoacyladenyláty
- nikotinamidadenindinukleotid (NAD+)
- nikotinamidadenindinukleotidfosfát (NADP+)
- flavinadenindinukleotid (FAD)
- koenzym A – tvoří například acetylkoenzym A
Literatura
- MURRAY, Robert K., et al. Harperova biochemie. Z angl. 23. vyd. přel. Jiří Kraml et al. 4. vyd. v ČR. Praha: H & H, 2002. ix, 872 s. ISBN 80-7319-013-3.
- MURRAY, Robert K., et al. Harperova biochemie. Z angl. 23. vyd. přel. Jiří Kraml et al. 3. vyd. v ČR. Praha: H & H, 2001. ix, 872 s. ISBN 80-7319-003-6.
- MURRAY, Robert K., et al. Harperova biochemie. Z angl. 23. vyd. přel. Jiří Kraml et al. 2. vyd. v ČR. Praha: H & H, 1996. ix, 872 s. ISBN 80-85787-38-5.
Související články
Externí odkazy
Obrázky, zvuky či videa k tématu nukleotid na Wikimedia Commons - Seznam děl v Souborném katalogu ČR, jejichž tématem jsou nukleotidy
