Lyáza

Lyáza je enzým, ktorý katalyzuje rozklad chemických väzieb („eliminačná“ reakcia) bez použitia hydrolýzy („substitučná“ reakcia, katalyzovaná hydrolázami) alebo oxidácie. V procese zvyčajne vzniká dvojitá väzba alebo cyklus. Enzým môže katalyzovať i opačnú reakciu (takzvaná Michaelova adícia). Príkladom je napríklad reakcia katalyzovaná adenylátcyklázou:

ATP → cAMP + PPi

Lyázy sa líšia od ostatných enzýmov v tom, že vyžadujú len jeden substrát pre reakciu v jednom smere, ale dva substráty v opačnom smere.

Názvoslovie

Systematické názvy sú tvorené ako "substrát skupina-lyáza". Medzi lyázy patria enzýmy ako sú dekarboxyláza, dehydratáza, aldoláza a podobne. Ak je produkt reakcie dôležitejší, je možné v názve použiť slovo syntáza, ako u fosfosulfolaktát syntázy (EC 4.4.1.19, Michaelova adícia siričitanu na fosfoenolpyruvát).

Kombináciu eliminácie a Michaelovej adície je možné vidieť napríklad v O-sukcinylhomoserín tiol-lyázy (MetY alebo MetZ), ktorá najprv katalyzuje γ-elimináciu O-sukcinylhomoserínu (počas ktorej odstupuje sukcinit) a následne adíciu sulfidu na vinylový intermediát. Táto reakcia bola najprv klasifikovaná ako lyáza (EC 4.2.99.9), ale potom bola zmenená na transferázu (EC 2.5.1.48).

Klasifikácia

Lyázy sú klasifikované ako EC 4 v EC číselnej klasifikácii enzýmov. Lyázy je ďalej možné zaradiť do 7 kategórií:

  • EC 4.1 zahŕňa lyázy, ktoré štiepia väzby uhlík-uhlík (C-C), ako sú dekarboxylázy (EC 4.1.1), aldehydové lyázy (EC 4.1.2), oxokyselinové lyáza (EC 4.1.3) a ostatné (EC 4.1.99)
  • EC 4.2 zahŕňa lyázy, ktoré štiepia väzby uhlík-kyslík (C-O), ako sú dehydratázy
  • EC 4.3 zahŕňa lyázy, ktoré štiepia väzby uhlík-dusík (C-N)
  • EC 4.4 zahŕňa lyázy, ktoré štiepia väzby uhlík-síra (C-S)
  • EC 4.5 zahŕňa lyázy, ktoré štiepia väzby uhlík-halogén (C-X, kde X = F, Cl, Br, I)
  • EC 4.6 zahŕňa lyázy, ktoré štiepia väzby fosfor-kyslík (P-O), ako napríklad adenylátcykláza alebo guanylátcykláza
  • EC 4.99 zahŕňa ostatné lyázy, ako je napríklad ferochelatáza

Membránové lyázy

Niektoré lyázy sú asociované s biologickými membránami ako periférne membránové proteíny alebo sú uchytené v membránach pomocou transmembránového helixu.[1]

Referencie
  1. Superfamilies of single-pass transmembrane lyases in Membranome database

Zdroj

Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Lyase na anglickej Wikipédii.

Chemický portál
Biologický portál
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.