Nukleotid
Nukleotidy alebo nukleozidfosfáty sú zlúčeniny nukleozidu a kyseliny trihydrogenfosforečnej. Nukleotid je základná stavebná jednotka nukleových kyselín a niektorých koenzýmov a niektoré plnia aj úlohu energetických prenášačov. Každý nukleotid sa skladá z fosfátovej zložky, sacharidovej zložky (ribóza – vtedy sa nazýva ribonukleotid alebo deoxyribóza – vtedy sa nazýva deoxinukleotid) a purínovej bázy (adenín, guanín) alebo pyrimidínovej bázy (cytozín, tymín, uracil).
- nukleoZid + kyselina fosforečná = nukleoTid
Názvoslovie
Názvoslovie nukleotidov zodpovedá stavbe daného nukleotidu: prvá časť slova označuje nukleozid a druhá časť udáva počet zvyškov kyseliny trihydrogenfosforečnej. Medzi nimi je číslo s apostrofom ('), ktoré označuje číslo uhlíka monosacharidu, na ktorom je nadviazaná kyselina trihydrogenfosforečná. Keďže fosforylácia najčastejšie prebieha na 5-uhlíku, názov ako adenozín-5'-monofosfát sa píše zjednodušene adenozínmonofosfát.
Zaviedli sa aj štvorpísmenové skratky. Prvé malé písmeno označuje prítomnosť monosacharidu ribózy (nepíše sa nič) alebo deoxyribózy (malé d). Ak je štruktúra nukleotidu cyklická, tak sa označuje malým c (cyklický adenozínmonofosfát, cAMP). Druhé, veľké písmeno označuje typ nukleovej bázy:
Tretie veľké písmeno určuje počet fosfátových skupín (mono-, di-, tri-). Nakoniec písmeno P označuje prítomnosť fosfátu.
Anhydridová väzba
Fosfátové skupiny v nukleoziddifosfátoch a nukleozidtrifosfátoch sú navzájom nadviazané anhydridovou väzbou. Pri hydrolýze týchto väzieb sa uvoľní veľké množstvo energie (Δ G < −30 kJ/mol), preto sú nukleotidy zlúčeninami, ktoré umožňujú aktiváciu rekreantov a priebeh endergonických reakcií.
Základné nukleotidy
Ribonukleotidy
adenozínmonofosfát AMP |
adenozíndifosfát ADP |
adenozíntrifosfát ATP |
guanozínmonofosfát GMP |
guanozíndifosfát GDP |
guanozíntrifosfát GTP |
uridínmonofosfát UMP |
uridíndifosfát UDP |
uridíntrifosfát UTP |
cytidínmonofosfát CMP |
cytidíndifosfát CDP |
cytidíntrifosfát CTP |
Deoxynukleotidy
deoxyadenozínmonofosfát dAMP |
deoxyadenozíndifosfát dADP |
deoxyadenozíntrifosfát dATP |
deoxyguanozínmonofosfát dGMP |
deoxyguanozíndifosfát dGDP |
deoxyguanozíntrifosfát dGTP |
deoxytymidínmonofosfát dTMP |
deoxytymidíndifosfát dTDP |
deoxytymidíntrifosfát dTTP |
deoxycytidínmonofosfát dCMP |
deoxycytidíndifosfát dCDP |
deoxycytidíntrifosfát dCTP |
Vzorce
AMP: C10H14N5O7P
GTP: C10H16N5O14P3
CDP: C9H15N3O11P2
Chemický portál |