Koenzym

Terminologie kofaktorů, koenzymů a prostetických skupin je značně nejednotná. Voet & Voet rozlišují dva druhy kofaktorů: koenzymy a prostetické skupiny, z nichž první se na enzymy vážou slabě a druhé kovalentně. Stejné pojetí zastává například Vodrážkova Enzymologie nebo Oxford Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology.

V současnosti je prostetická skupina obvykle chápána jako pevně vázaná a stabilní součást molekuly enzymů, zatímco koenzym se váže pouze slabě a snadno disociuje. U termínu prostetická skupina je kladen důraz na těsný charakter vazby na enzym a na definici strukturálních vlastností enzymu. Termín koenzym naopak definuje především funkční vlastnosti enzymu. V reálné biochemii však neexistuje jasný přechod mezi koenzymy a prostetickými skupinami.

Schéma reakce substrátu s enzymem pomocí volně navázaného koenzymu.

Koenzym je organická molekula o nízké molekulární váze, která se nekovalentně váže na enzym, po katalýze se odštěpuje a regeneruje. Během reakce absorbuje nebo uvolňuje funkční skupiny, protony, elektrony nebo energii (princip donor-akceptor).

Známým koezymem pro enzymaticky katalyzované reakce je adenosintrifosfát (ATP), ze kterého mohou být energeticky bohaté fosfátové skupiny (s tvorbou ADP nebo AMP) přeneseny do jiných molekul a ty mohou být aktivovány. Tato reakce se nazývá fosforylace, tedy navázání zbytků kyseliny fosforečné.

Dalšími důležitými koenzymy jsou deriváty vitamínů (většinou B-komplex). Obvykle jsou tvořeny heterocyklickou sloučeninou.

Naprostá většina koenzymů je rozpustná ve vodě. Výjimku tvoří koenzym Q10, který přenáší protony mezi enzymy dýchacího řetězce ve vnitřní membráně mitochondrií.

Hlavní úlohou koenzymů je přenos atomů, jejich skupin nebo samotných elektronů mezi odlišnými enzymy, čímž zajišťují spřažení různých biochemických reakcí. Během spřažených reakcí se koenzymy regenerují. Koenzym, který zreagoval v jedné reakci, přechází na jiný apoenzym, kde se v nové reakci dostává do původního stavu. Hladina aktivních koenzymů v buňce je tak udržována na víceméně stejné úrovni.

Koenzymy volně vázané na enzymy, podobně jako prostetické skupiny pevně vázané na enzymy, řídí rychlost reakcí ve všech živých organismech. Tyto reakce probíhají cíleně podle genetického plánu organismu, přesně na sebe navazují, vzájemně se koordinují a mají specifický průběh bez vzniku vedlejších produktů. Aktivita enzymů je pružně regulo­vána podle měnících se potřeb organismu.

Předpokládá se, že i nejjednodušší buňky obsahují přes 3 000 enzymů a protože každý biologický druh má své vlastní enzymy, odhaduje se počet existu­jí­cích enzymů na miliardy.

Koenzym a prostetická skupina se odlišují ve způsobu katalytické reakce a zpětné regene­ra­ce (přechodu do původního stavu po splnění katalytické funkce):

• Snad­no od­ště­­­pi­telné koenzymy na apoenzymu a substrát reagují jako jako dva reaktanty. Po proběhnutí reakce přechází zreago­­vaný koenzym na jiný apoenzym a tam reaguje s dalším substrátem, čímž se rege­neruje. Katalytické působení koenzymů je tedy realizováno spřažením dvou reakcí pro­váděných dvěma apoenzymy.
• Průběh reakce u prostetických skupin je určen jejich pevnou vazbou k apoenzymu. Prostetické skupiny krátce po sobě reagují se dvěma substráty, přičemž obě reakce realizuje tentýž apoenzym. Na rozdíl od koenzymu se tak katalytické reakce a regenerace zúčastňuje pouze jeden apoenzym.

• nikotinamidadenindinukleotid, NAD, hlavní koenzym oxidoreduktáz, přijímá protony a elektrony z dehydrogenačních reakcí a předává je do Krebsova cyklu, součástí je niacin
• nikotinamidadenindinukleotidfosfát, NADP, jeho redukovaná forma NADPH je redukční činidlo biosyntéz (např. temnostní fáze fotosyntézy, syntéza mastných kyselin apod.)
• koenzym A – přenašeč acylových skupin, uplatňuje se proto při transacylačních reakcích, součástí je kyselina pantothenová
• koenzym Q10 – přenašeč náboje v dýchacím řetězci
• pyridoxalfosfát – PLP derivát vitaminu B₆ se účastní přenosu aminoskupin
• thiamindifosfát – TDP derivát vitaminu B₁ se účastní přenosu aldehydových skupin

V tomto článku byly použity překlady textů z článků Cofactor (biochemistry) na anglické Wikipedii a Cofaktor (biochemie) na německé Wikipedii.

• Obrázky, zvuky či videa k tématu Koenzym na Wikimedia Commons