RNA editace

RNA editace je proces posttranskripční úpravy RNA, kterým některé buňky vyvolávají specifické změny v sekvenci nukleotidů v molekule RNA poté, co byla syntetizována RNA polymerázou, sekvence editované RNA tedy neodpovídá sekvenci genu, který ji kóduje. Editace RNA je relativně vzácný pochod a běžné posttranskripční modifikace, jako přidání 5'čepičky, polyadenylace nebo splicing, se většinou jako "editace RNA" neoznačují.

Komplex editosomu upravujícího mRNA podle informace nesené v gRNA. gRNA je přesně komplementární k 3' konci mRNA ("kotvící oblast", anchor region), oblasti mRNA, které přesně neodpovídají sekvenci gRNA jsou podle gRNA upraveny vložením nebo odebráním zbytků uracilu

RNA editace probíhá ve všech doménách života, u eukaryot (včetně jejich semiautonomních organel) a jejich virů, bakterií, archebakterií.[1] U obratlovců je editace RNA relativně vzácná a bodově mění některé molekuly RNA, u některých organismů, například kinetoplasid probíhá takzvaná pan-editace, při které je upravena většina nukleotidů v RNA sekvenci některých mRNA

Po biochemické stránce je RNA editace řada různých pochodů, které se v evoluci vyvinuly nezávisle. Jedná se především o deaminace, přeměnu cytidinu na uridin a adenosinu na inosin.[2] Dalším významným typem je přidávání nebo odebírání nukleotidů nezávisle na templátu.

Speciálně v poslední době byla diskutována otázka rozsáhlé editace RNA u hlavonožců (Sciencemag, Gate2Biotech).

Reference

V tomto článku byl použit překlad textu z článku RNA editing na anglické Wikipedii.

  1. SU, A. A. H., Randau, L. A-to-I and C-to-U editing within transfer RNAs. Biochemistry (Moscow). 2011, roč. 76, čís. 8, s. 932–937. DOI 10.1134/S0006297911080098.
  2. ZINSHTEYN, Boris, Nishikura, Kazuko. Adenosine-to-inosine RNA editing. Wiley Interdisciplinary Reviews: Systems Biology and Medicine. 2009-09-01, roč. 1, čís. 2, s. 202–209. DOI 10.1002/wsbm.10.

Další literatura
  • NISHIKURA, Kazuko. Editor meets silencer: crosstalk between RNA editing and RNA interference. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2006-12-01, roč. 7, čís. 12, s. 919–931. DOI:10.1038/nrm2061.

Související články
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.