RNA polymeráza

RNA polymeráza (RNAP) je enzym, který katalyzuje syntézu RNA podle vzoru - příslušné části řetězce DNA (či vzácně podle jiné RNA). Díky tomuto enzymu vznikají mezi danými nukleosidtrifosfáty (ATP, CTP, GTP, UTP) fosfodiesterové vazby, čímž se spojují do řetězce několika tisíc nukleotidů. RNA polymeráza hraje klíčovou roli v procesu transkripce.[1]

Bakteriální RNA polymeráza; na obrázku z bakterie Thermus aquaticus

RNA polymeráza udělá chybu jednou za 104 nukleotidů, tedy asi 1 000× častěji, než DNA polymeráza (po proofreadingu).[1] Regulaci transkripce zajišťují zejména tzv. transkripční faktory, které se mnohdy vážou na RNA polymerázu.

Klasifikace

Rozlišují se:[2]

  • DNA-dependentní RNA polymerázy – vzorem pro jejich činnost je řetězec DNA
  • RNA-dependentní RNA polymerázy – vzorem pro jejich činnost je řetězec RNA, jedná se spíše o výjimku.

Typy RNA polymeráz

U bakterií

Bakterie mají zřejmě jedinou RNA polymerázu, ta je však složená z několika podjednotek:[2]

  • α podjednotka (velikost 36,5 kDa) – váže se na promotor;
  • β′ podjednotka (155,2 kDa) – váže se na DNA;
  • β podjednotka (150,6 kDa) – umožňuje samotnou polymerizační aktivitu
  • σ podjednotka (sigma faktor) – významná pro iniciaci transkripce (otevře dvoušroubovici).

U eukaryot

U eukaryot jsou tři základní typy RNA-polymeráz,[1] všechny jsou složené z mnoha podjednotek (například RNAP jich má kolem 12[2]):

U rostlin se vyskytuje navíc i tzv. RNA polymeráza IV (přepisuje siRNA).[3]

Archea mají zřejmě jen jedinou RNA polymerázu, nápadně podobnou těm eukaryotickým.[4]

Odkazy

Reference
  1. ALBERTS, Bruce, et al. Essential Cell Biology. 2. vyd. New York: Garland Science, 2004. Dostupné online.
  2. RÉDEI, George P. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. 3rd Edition. vyd. [s.l.]: Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.
  3. Herr AJ, Jensen MB, Dalmay T, Baulcombe DC. RNA polymerase IV directs silencing of endogenous DNA. Science. 2005, roč. 308, čís. 5718, s. 118–20. DOI 10.1126/science.1106910. PMID 15692015.
  4. D Langer, J Hain, P Thuriaux and W Zillig (1995) Transcription in Archaea: Similarity to that in Eucarya PNAS 92 5768-5772

Související články

Externí odkazy
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.