RIG-I
RIG-I (retinoic acid-inducible gene I) je spolu s MDA5 a LGP2 součástí skupiny RIG-I-like receptorů, která patří mezi cytoplazmatické pattern recognition receptory (PRR). RIG-I hraje klíčovou roli během antivirové obrany, neboť rozpoznává dvouřetězcovou RNA (dsRNA) [1]. Je exprimován v naprosté většině buněk s jádry, což napovídá jeho významné roli v boji proti virovým infekcím [2]. Jedná se o protein kódovaný u lidí genem DDX58 [1].
Struktura
RIG-I patří mezi ATP-dependentní DExD/H box RNA helikázy. Na svém N-konci má 2 CARD domény důležité pro signalizaci, helikázovou doménu, která je tvořena doménami nazvanými Hel1, Hel2 a Hel2i, na které navazuje C-terminální doména (CTD). Ta dokáže rozpoznat a navázat RNA[1][2] .
Funkce
RIG-I je pattern recognition receptor, který specificky rozeznává dsRNA o délce menší než 300 párů bází. Ideálním ligandem tohoto receptoru je tedy dsRNA, která má na svém 5'konci navázány tři fosfátové zbytky. Jakmile dojde k navázání ligandu, dojde ke změně konformace RIG-I, který přejde do aktivního stavu. Ten vede k tomu, že CARD RIG-I domény nyní mohou interagovat s CARD doménami mitochondriálních antivirových signálních proteinů (MAVS), které zprostředkují spuštění signálních kaskád vedoucích k produkci prozánětlivých cytokinů a interferonů typu 1. Produkované Interferony se mohou vázat na své receptory na buněčném povrchu a kromě toho také aktivovat JAK/STAT dráhu vedoucí k produkci ISG[3].
Reference
- BRISSE, Morgan; LY, Hinh. Comparative Structure and Function Analysis of the RIG-I-Like Receptors: RIG-I and MDA5. Frontiers in Immunology. 2019, roč. 10, s. 1586. PMID: 31379819 PMCID: PMC6652118. Dostupné online [cit. 2022-02-06]. ISSN 1664-3224. DOI 10.3389/fimmu.2019.01586. PMID 31379819.
- THORESEN, Daniel; WANG, Wenshuai; GALLS, Drew. The molecular mechanism of RIG-I activation and signaling. Immunological Reviews. 2021-11, roč. 304, čís. 1, s. 154–168. PMID: 34514601. Dostupné online [cit. 2022-02-06]. ISSN 1600-065X. DOI 10.1111/imr.13022. PMID 34514601.
- IVASHKIV, Lionel B.; DONLIN, Laura T. Regulation of type I interferon responses. Nature Reviews. Immunology. 2014-01, roč. 14, čís. 1, s. 36–49. PMID: 24362405 PMCID: PMC4084561. Dostupné online [cit. 2022-02-06]. ISSN 1474-1741. DOI 10.1038/nri3581. PMID 24362405.