MDA5

MDA5 dokáže rozpoznat dlouhou dsRNA, genomovou RNA dsRNA virů i replikativní meziprodukty pozitivních i negativních RNA virů.[7] Ukázalo se také, že MDA5 interaguje s řadou chemických modifikací RNA. Například eukaryotická mRNA je často methylována v poloze 2’-O prvního a druhého nukleotidu za 5´ čepičkou.[8] Tyto struktury se nazývají cap1 a cap2.[9] MDA5 je schopen detekovat nepřítomnost 2'-O-methylace, navázat se na tento typ RNA a zahájit imunitní odpověď.[10]

Aktivovaný MDA5 interaguje s mitochondriálními antivirovými signálními proteiny (MAVS) prostřednictvím svých aktivačních a náborových domén kaspáz (CARD) na N-konci molekuly.[11] MAVS pak fungují jako multiproteinový komplex a rekrutují inhibitor nukleárního faktoru kappa B, konkrétně kinázové podjednotky epsilon (IKKε) spolu se serin/treonin-proteinovou kinázou 1 (TBK1).[12] To způsobí fosforylaci a transport interferonových regulačních faktorů 3 a 7 (IRF3 a IRF7) do jádra buňky. Regulační faktory pak v jádru indukují transkripci interferonových genů typu I IFN-β a IFN-α.[13]

MDA5 se řadí mezi ATP dependentní DExD/H box RNA helikázy. Skládá se ze 2 CARD domén na svém N-konci, peptidického pantu a helikázové domény složené z domén typu RecA-like Hel1 a Hel2.[14] Dalším peptidickým pantem je pak připojena C-terminální doména (CTD), která je schopná rozpoznávat a vázat RNA.[15] Kromě kladně nabitého žlábku, který rozpoznává RNA obsahuje CTD také zinek vázající doménu.[16]