Molekulární marker

Molekulární marker (molekulární identifikační znak) je cíleně či náhodně vybraná informace o vzorku, nejčastěji biologickém materiálu, která byla získána prostřednictvím analýzy jeho molekul.

Příkladem molekulárního markeru může být náboj molekuly enzymu, pořadí nukleotidů v sekvenci DNA, či délka fragmentu DNA. Tyto znaky mohou být specifické na různých úrovních (pro konkrétní jedince, přes populace až po všechny organismy), mají proto všestranné využití zejména v lékařství a přírodních vědách. Na příklad specifické oblasti DNA se používají k diagnostice autosomální recesivní genetické poruchy cystické fibrózy[1], další diagnostické testy (např. pro komplexní neurodegenerativní onemocnění, Alzheimerovu chorobu), využívají i analýzu proteinů[2]. Dalším z uplatnění molekulárních markerů je zjištění příbuznosti (ať již pro forenzní, či vědecké účely).

Nejběžněji používané molekulární markery

Izoenzymy - tedy enzymy mající stejnou funkci, ale jinou strukturu, lze vzájemně odlišit prostřednictvím gelové elektroforézy.
Genetické (DNA) markery

RFLP (Polymorfismus délky restrikčních fragmentů)
analýza fragmentů DNA (založené na PCR)
1. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)
2. AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)
3. ISSRs (Inter Simple Sequence Repeats)
4. PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction – RFLP)
5. mikrosatelity (Simple Sequence Repeats – SSRs)
6. SCP (Single Strain Conformation Polymorphism)
celogenomové markery (založené na sekvenaci DNA)
1. SNP (Jednonukleotidový polymorfismus)
2. HybSeq
3. RADseq

Reference

BRADLEY, Linda A.; JOHNSON, Dorene A.; CHAPARRO, Carlos A.; ROBERTSON, Nancy H.; FERRIE, Richard M. A Multiplex ARMS Test for 10 Cystic Fibrosis (CF) Mutations: Evaluation in a Prenatal CF Screening Program. Genetic Testing. Leden 1998, roč. 2, čís. 4, s. 337–341. DOI 10.1089/gte.1998.2.337. (anglicky)
CHOE, Leila H.; DUTT, Michael J.; RELKIN, Norman; LEE, Kelvin H. Studies of potential cerebrospinal fluid molecular markers for Alzheimer's disease. Electrophoresis. Červen 2002, roč. 23, čís. 14, s. 2247–2251. DOI 10.1002/1522-2683(200207)23:14<2247::aid-elps2247>3.0.co;2-m. PMID 12210229. (anglicky)

Externí odkazy

Virtual Learning Environment (Institute of Lifelong Learning, University of Delhi) - přehled metod (anglicky)
Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin - výukové materiály Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy
Izolace DNA a genetické markery - wikiskripta
Aplikace molekulární biologie v lesnictví - molekulární markery

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] BRADLEY, Linda A.; JOHNSON, Dorene A.; CHAPARRO, Carlos A.; ROBERTSON, Nancy H.; FERRIE, Richard M. A Multiplex ARMS Test for 10 Cystic Fibrosis (CF) Mutations: Evaluation in a Prenatal CF Screening Program. Genetic Testing. Leden 1998, roč. 2, čís. 4, s. 337–341. DOI 10.1089/gte.1998.2.337. (anglicky)

[2] CHOE, Leila H.; DUTT, Michael J.; RELKIN, Norman; LEE, Kelvin H. Studies of potential cerebrospinal fluid molecular markers for Alzheimer's disease. Electrophoresis. Červen 2002, roč. 23, čís. 14, s. 2247–2251. DOI 10.1002/1522-2683(200207)23:14<2247::aid-elps2247>3.0.co;2-m. PMID 12210229. (anglicky)