Super Metroid

Rovnako ako dve predchádzajúce hry, aj Super Metroid je nelineárna 2D akčná hra založená na preskúmavaní rozhľahlých lokácii. Okrem lepšej grafickej a zvukovej kvality mala táto hra mnohé iné vylepšenia hrateľnosti. Medzi tie najväčšie patrí citlivejšie ovládanie, schopnosť strielať do ôsmich smerov a mapa, ktorá zaznamenáva všetky navštívené lokácie. Základné mechanizmy série však boli zachované.

Počas hry hráč získava rôzne nové zbrane a schopnosti, ako napr. ľadový lúč, ktorý dokáže zmraziť nepriateľov, alebo schopnosť odrážať sa počas skákania od stien. Porazení nepriatelia po sebe opäť nechávajú liečivú energiu a muníciu. Systém ukladania hry je rovnaký ako v Metroid II: Return of Samus — hráč si môže uložiť svoju pozíciu v mnohých špeciálnych miestnostiach, ktoré sú rozptýlené po hernom svete.

Super Metroid má tri rôzne konce založené na tom ako dlho hráčom trvalo prejsť hru. Konce sa líšia v pozíciách, v ktorých Samus pózuje, a tiež v tom či v nich má oblečený svoj Power Suit alebo nie. Najlepší z nich sa dosiahne prejdením celej hry za menej než tri hodiny.

Lovkyňa odmien Samus Aran na začiatku hry rekapituluje udalosti, ktoré sa stali v predchádzajúcich dvoch hrách. Rozpráva o tom, ako na planéte SR388 objavila mláďa Metroida, ktoré ju začalo považovať za svoju matku, a ako toto mláďa odovzdala vedcom Galaktickej federácie na vesmírnej stanici Ceres. Krátko potom, čo zo stanice odišla ale zachytí núdzový signál a vracia sa späť. Samus nachádza stanicu zničenú a všetkých vedcov mŕtvych. Stretáva tam Ridleyho, obávaného vodcu pirátov, ktorý ukradol mláďa Metroida. Samus sa ho pokúša zastaviť, ale je neúspešná a Ridley uteká preč. Na stanici sa aktivuje autodeštrukčný systém a Samus ju rýchlo opúšťa.

Samus vo svojej lodi prenasleduje Ridleyho na planétu Zebes, kde počas preskúmavania jaskýň a podzemných tunelov zisťuje, že piráti zrekonštruovali ich tamojšiu základňu, ktorú Samus dávnejšie zničila. Počas prechádzania rozličnými sektormi stanice bojuje s množstvom nebezpečných tvorov a pirátov, a tiež musí čeliť ich štyrom nebezpečným vodcom, medzi ktorých patrí aj Ridley. Potom, čo ich úspešne porazí sa dostáva do jadra stanice, kde ju napadne mláďa, z ktorého sa už ale stal obrovský dospelý Metroid. Tento Metroid z nej vysaje takmer všetku energiu, no zrazu si uvedomí kto Samus je a uteká preč.

Samus sa zregeneruje, postupuje ďalej a nachádza vylepšenú a nebezpečnejšiu verziu Mother Brain — kybernetický organizmus, ktorý ovláda všetky systémy pirátskej stanice. Samus súboj prehráva, ale tesne predtým ako ju Mother Brain stihne zabiť sa objavuje dospelý Metroid, ktorý jej protivníka napadne, vysáva z neho energiu a tým ho porazí. Metroid potom prevádza všetku nahromadenú energiu na Samus, a tým jej zachraňuje život. Počas celého procesu sa ale Mother Brain stihne reštartovať a zabíja Metroida. Samus ale využije všetku svoju novú energiu na posilnenie svojej zbrane a úspešne Mother Brain zničí. Tým sa aktivuje celoplanetárna autodeštrukcia, a Samus vo svojej lodi rýchlo uteká preč.