Chrupkokostnaté

• Nemajú interoperkulum
• Väčšinou majú prieduch
• Čeľuste sú zavesené veľmi zvláštnym spôsobom

Ďalšie znaky chrupkokostnatých v užšom zmysle:

• Recentné druhy majú chrupavkovitú kostru.
• Chvostová plutva je heterocerkná.
• Množstvo šupín je malé.

Inak ale ide o zoskupenie pomerne rôznorodých skupín rýb.

Systematika tejto skupiny je stále pomerne sporná. V starších systémoch sa sem zaraďuje aj skupina Cladistia.

Nasleduje systematika prevažne podľa Benton 2004/2005 a Nelson 2006:

• čeľaď †Amphicentridae – u Bentona 2004/2005 v jednej skupine spolu s Dorypteriidae a Redfieldiidae
• rad †Cheirolepidiformes
  • čeľaď †Cheirolepididae – zaraďované aj priamo pod Actinopterygii
• rad †Palaeonisciformes – parafyletická skupina
  • ?rod †Coccolepidae
  • ?rod †Illiniichthys
  • ?rod †Nozamichthys
  • ?čeľaď †Cornuboniscidae
  • ?čeľaď †Cryphiolepidae
  • ?čeľaď †Centrolepidae
  • ?čeľaď †Scanilepidae
  • ? čeľaď †Tegeolepidae
  • ? čeľaď†Carbovelidae
  • ? čeľaď†Sctyracopteridae
  • ? čeľaď†Holuriidae
  • ? čeľaď †Cosmoptychiidae
  • ? čeľaď †Dicellopygidae
  • podrad †Palaeoniscoidei
    • čeľaď †Canobiidae
    • čeľaď †Acrolepidae (Acrolepididae)
    • čeľaď †Aeduellidae
    • čeľaď †Amblypteridae (vrátane Paramblypteridae, Paramlybteriformes; zaraďované aj pod chondrostei v širšom zmysle)
    • čeľaď †Commentryidae
    • čeľaď †Elonichthyidae
    • čeľaď †Palaeoniscidae
    • čeľaď †Pygopteridae
    • čeľaď †Rhabdolepidae
    • čeľaď †Aesopichthyidae
    • čeľaď † Stegotrachelidae – zaraďované aj priamo pod Actinopteri
    • čeľaď †Rhadinichthyidae (vrátane Aesopichthyidae)
  • podrad †Redfieldioidei (Catopteridae, Dictyopygidae) – zaraďované aj vyššie pod Chondrostei v širšom zm., u Bentona v jednej skupine spolu s Amphicentridae a Dorapteriidae
    • čeľaď † Redfieldiidae
  • podrad †Platysomoidei – zaraďované aj pod Chondrostei v širšom zm.
    • čeľaď †Bobastraniidae
    • čeľaď †Chirodontidae
    • čeľaď †Platysomidae
  • podrad †Dorypteroidei
    • čeľaď †Dorypteridae– u Bentona v jednej skupine spolu s Amphicentridae a Redfieldiidae; zaraďované aj vyššie pod Chondrostei v širšom zmysle
• ?rad † Terrasiiformes
  • čeľaď †Terrasiidae – rody Apholidotos, Tarrasius a Paratarrasius
• rad †Guildayichthyiformes– zaraďované aj pod Cladistia
  • čeľaď †Guildayichthyidae
• rad †Phanerorhynchiformes – zaraďované aj pod Palaeonisciformes
• rad †Saurichthyiformes – zaraďované aj pod Chondrostei v užšom zmysle
  • čeľaď †Saurichthyidae
• rad †Perleidiformes
  • ? čeľaď †Aethodontidae
  • ? čeľaď †Cephaloxenidae – zaraďované aj pod Peltopleuriformes
  • ? čeľaď †Cleithrolepidae
  • ? čeľaď † Platysiagidae
  • čeľaď †Perleididae v širšom zm. (Colobodontidae) – zahŕňa početné druhy + Perleididae v užšom zmysle
• rad †Pholidopleuriformes
  • ?rod †Gracilignathichthys
  • čeľaď †Pholidopleuridae
• rad †Peltopleuriformes
  • rod †Hadroichthys
  • ?čeľaď Polzbergiidae
  • čeľaď †Peltopleuridae
  • čeľaď †Thoracopteridae
• rad †Ptycholepiformes
  • čeľaď †Ptycholepididae
• rad †Luganoiiformes
  • čeľaď †Luganoiidae
  • čeľaď †Hadroichtyidae
  • čeľaď †Thoracopteridae
• rad †Haplolepiformes
  • čeľaď †Haplolepidae
• (-) chrupkokostnaté/chrupkovité ryby (Chondrostei) v užšom zmysle
  • čeľaď †Birgeriidae – zaraďované aj pod Palaeonosciformes
  • rad jeseterotvaré (jesetery; Acipenseriformes)
    • ?čeľaď † Errolichthyidae
    • podrad † Chondrosteoidei
      • čeľaď †Chondrosteidae – zaraďované aj mimo Acipenseriformes pod Chondrostei v užšom zmysle
    • (-)Acipenseristomi
      • čeľaď †Peipiaosteidae – poloha neistá
      • podrad Acipenseroidei
        • čeľaď jeseterovité (Acipenseridae)
        • čeľaď veslonosovité (Polyodontidae)
• (Neopterygii – vývojovo patrí sem, ale tradične sa zaraďuje oddelene)