Rag
Rag je menší rodina GTPáz vyskytující se u většiny eukaryotických organismů s výjimkou zelených řas a vyšších rostlin.[1] Členy této rodiny jsou u kvasinek proteiny Gtr1 a Gtr2, u savců, jako je člověk, jsou to GTPázy RagA, RagB, RagC a RagD. Platí, že lidské GTPázy RagA a RagB jsou si velmi podobné a vznikly genovou duplikací, to samé platí pro dvojici RagC a RagD.[2] Strukturně jsou Rag proteiny podobné ostatním malým GTPázám (jako jsou např. Rab proteiny), ale v některých detailech se liší, zejména v oblasti prodloužených C-terminálních domén, které umožňují heterodimerizaci Rag proteinů mezi sebou, a dále absencí lipidových modifikací na C-konci.[2]
Funkce
RagA/B vytváří heterodimery s RagC/D a slouží jako senzory množství aminokyselin v buňce. Vazba GTP či GDP ovlivňuje aktivitu Rag GTPáz: aktivní Rag dimer má na RagA/B podjednotce navázané GTP a na RagC/D podjednotce GDP; v této konfiguraci se Rag dimer nachází, pokud má buňka k dispozici velké množství aminokyselin. Rag proto v takovém případě aktivuje mTOR komplex, který stimuluje jejich metabolismus. Situace je opačná u neaktivního Rag dimeru, který je typický pro stav aminokyselinové deprivace.[2]
Reference
- TATEBE, Hisashi; SHIOZAKI, Kazuhiro. Evolutionary Conservation of the Components in the TOR Signaling Pathways. Biomolecules. 2017-11-01, roč. 7, čís. 4, s. 77. Dostupné online [cit. 2018-08-14]. DOI 10.3390/biom7040077. PMID 29104218. (anglicky)
- NICASTRO, Raffaele; SARDU, Alessandro; PANCHAUD, Nicolas. The Architecture of the Rag GTPase Signaling Network. Biomolecules. 2017-06-30, roč. 7, čís. 3, s. 48. Dostupné online [cit. 2018-08-14]. DOI 10.3390/biom7030048. (anglicky)