Mikrosatelit
Mikrosatelit (též krátké tandemové repetice nebo SSR = Simple Sequence Repeat či také STR = short tandem repeats) je označení pro sekvence repetitivní DNA, složené z opakujících se jednotek o velikosti obvykle do šesti nukleotidů. Tyto jednotky se v jednom mikrosatelitu mnohokrát opakují, přičemž počet opakování (tedy délka fragmentu) je unikátní pro každého jedince.[1][2] STR oblast se může u daného člověka nacházet buď v homozygotním nebo heterozygotním stavu v závislosti na délce opakujícího se fragmentu v obou alelách. V lidském genomu jsou STR oblasti rozmístěny na většině chromosomů a obvykle se nachází v oblastech tzv. intronů. [2][3]
Využití
Díky diverzitě mikrosatelitů v populaci je analýza STR oblastí jednou ze základních metod pro forenzní analýzu. Detekce je založena na amplifikaci cílených úseků pomocí PCR s následným rozdělením vzniklých fragmentů pomocí elektroforézy. Další využití nachází analýza STR oblastí v otázkách genetického mapování nebo v případě testů otcovství. [2][3]
Reference
- MeSH Microsatellite Repeats
- KODÍČEK, Milan; VALENTOVÁ, Olga. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. 2. vyd. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2018. 408 s. ISBN 978-80-7592-013-3. S. 198.
- Background information on STRs. strbase.nist.gov [online]. [cit. 2022-04-30]. Dostupné online.
Literatura
- KODÍČEK, Milan; VALENTOVÁ, Olga. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. 2. vyd. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2018. 408 s. ISBN 978-80-7592-013-3. S. 198.
Externí odkazy
- Obrázky, zvuky či videa k tématu Mikrosatelit na Wikimedia Commons