Mikrosatelit

Mikrosatelit (též krátké tandemové repetice nebo SSR = Simple Sequence Repeat či také STR = short tandem repeats) je označení pro sekvence repetitivní DNA, složené z opakujících se jednotek o velikosti obvykle do šesti nukleotidů. Tyto jednotky se v jednom mikrosatelitu mnohokrát opakují, přičemž počet opakování (tedy délka fragmentu) je unikátní pro každého jedince.[1][2] STR oblast se může u daného člověka nacházet buď v homozygotním nebo heterozygotním stavu v závislosti na délce opakujícího se fragmentu v obou alelách. V lidském genomu jsou STR oblasti rozmístěny na většině chromosomů a obvykle se nachází v oblastech tzv. intronů. [2][3]

Využití

Díky diverzitě mikrosatelitů v populaci je analýza STR oblastí jednou ze základních metod pro forenzní analýzu. Detekce je založena na amplifikaci cílených úseků pomocí PCR s následným rozdělením vzniklých fragmentů pomocí elektroforézy. Další využití nachází analýza STR oblastí v otázkách genetického mapování nebo v případě testů otcovství. [2][3]

Reference

  1. MeSH Microsatellite Repeats
  2. KODÍČEK, Milan; VALENTOVÁ, Olga. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. 2. vyd. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2018. 408 s. ISBN 978-80-7592-013-3. S. 198.
  3. Background information on STRs. strbase.nist.gov [online]. [cit. 2022-04-30]. Dostupné online.

Literatura

  • KODÍČEK, Milan; VALENTOVÁ, Olga. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. 2. vyd. Praha: Vysoká škola chemicko-technologická, 2018. 408 s. ISBN 978-80-7592-013-3. S. 198.

Externí odkazy

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.