Gemmatimonadetes

Bakteriální kmen Gemmatimonadetes (nově též Gemmatimonadota) byl formálně ustaven v roce 2003. Do současné doby obsahuje pouze pět popsaných druhů a dělí se do 2 tříd: Gemmatimonadetes a Longimicrobia. Jeho zástupci jsou aerobní a semiaerobní heterotrofní organismy. Gemmatimonadetes jsou relativně běžnou složkou půdních mikrobiálních společenstev, kde tvoří 1-2% přítomných bakterií. Nacházíme je ovšem také ve sladkých vodách, čistírnách odpadních vod a sedimentech.

Gemmatimonadetes
Vědecká klasifikace
Doménabakterie (Bacteria)
KmenGemmatimonadetes (nově Gemmatimonadota)
Zhang a kol. 2003
třídy

Gemmatimonadetes (Zhang a kol., 2003) Longimicrobia (Pascual a kol. 2016)

Některá data mohou pocházet z datové položky.

Popsané druhy

První druh kmene Gemmatimonadetes bakterie Gemmatimonas aurantiaca T-27T byla popsána roku 2003. Tato gramnegativní, tyčinkovitá a aerobní bakterie byla kultivován z aktivovaného kalu čističky odpadních vod.[1] Druhým popsaným druhem byla roku 2013 bakterie Gemmatirosa kalamazoonensis KBS708, která byla izolována z organicky obdělávané půdy v Michiganu v USA.[2]

Dalším popsaným druhem byla Gemmatimonas phototrophica AP64T, která byla roku 2014 izolována z mělkého sladkovodního jezera Tiān é hú nacházejícím se v čínské provincii Vnitřní Mongolsko[3]. Unikátní vlastností tohoto organismu je přítomnost fotosyntetických reakčních center. Tento organismus pravděpodobně získal své fotosyntetické geny horizontálním přenosem z fototrofních Proteobakterií. G. phototrophica je fakultativní fotoheterotrof. Pro svůj růst potřebuje přísun organických látek, ale je schopen pokrýt velkou část svých metabolických potřeb pomocí světelné energie.[4]

Bakterie Longimicrobium terrae CB-286315T byla izolována ze vzorku lesní půdy poblíž španělské Granady. Vzhledem ke své značné fylogenetické odlišnosti ustavila roku 2016 i novou třídu nazvanou Longimicrobia.[5] Posledním kultivovaným zástupcem Gemmatimonadetes je Roseisolibacter agri AW1220T izolovaný ze zemědělské půdy v Namibii.[6]

Reference
  1. Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov.. Int J Syst Evol Microbiol. 2003, roč. 53, čís. Pt 4, s. 1155–63. Dostupné v archivu pořízeném dne 2008-06-07. Archivováno 7. 6. 2008 na Wayback Machine
  2. DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. Gemmatirosa kalamazoonesis gen. nov., sp. nov., a member of the rarelycultivated bacterial phylum Gemmatimonadetes.. J Gen Appl Microbiol. 2013, roč. 59, s. 305–312.
  3. Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca.. Int J Syst Evol Microbiol. 2015, roč. 65, s. 2410–2419.
  4. Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes.. Proc Natl Acad Sci USA. 2014, roč. 111, s. 7795–7800.
  5. Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. Longimicrobium terrae gen. nov., sp. nov., a novel oligotrophic bacterium of the underrepresented phylum Gemmatimonadetes isolated through a system of miniaturized diffusion chambers.. Int J Syst Evol Microbiol. 2016, roč. 66, s. 1976–1985.
  6. PASCUAL, J., Foesel B.U., Geppert A., Huber K.J., Boedeker C., Luckner M., Wanner G., Overmann J. Roseisolibacter agri gen. nov., sp. nov., a novel slow-growing member of the under-represented phylum Gemmatimonadetes. Int J Syst Evol Microbiol. 2018, roč. 68, s. 1028–1036.

Externí odkazy
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.