EF-ruka

EF-ruka (z angl. EF-hand) je proteinový motiv složený ze dvou alfa-helixů („helix-turn-helix“), který váže vápenaté ionty. EF hand byl popsán u kalmodulinu a pojmenován podle toho, že ho tvoří helixy E a F, a že připomíná lidskou ruku v určité poloze – jeho stavbu je možné napodobit pomocí pravé ruky, přičež palec a ukazovák ukazují ven a zbytek prstů je sbalen v pěsti. Palec a ukazovák v takovém případě představují helixy E a F, zatímco zbytek dlaně reprezentuje smyčku, v níž je navázán atom vápníku.[1]

Kalmodulin z prvoka Paramecium – patrný motiv EF-ruky

EF-ruka se vyjma kalmodulinu vyskytuje i v mnohých dalších vápník vázajících proteinech – k takovým patří např. různé enzymy (proteinkinázy s kalmodulinovou doménou či proteáza kalpain), cytoskeletární proteiny (alfa-aktinin, centrin, troponin C) a další (kalbindin-D28K, kalretinin, parvalbumin, S100 proteiny a rekoverin).[2]

Reference
  1. Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition. Příprava vydání R. Cammack et al. New York: Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1.
  2. LODISH, Harvey, et al.. Molecular Cell Biology. 5. vyd. New York: W.H. Freedman and Company, 2000. Dostupné online.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.